Puromycin hoạt động kém trên E. coli. Các chất biến đổi kháng Puromycin được chọn trong môi trường thạch LB bổ sung puromycin 125 µg/ml. Nhưng việc sử dụng puromycin để lựa chọn E.coli đòi hỏi phải điều chỉnh pH chính xác và cũng phụ thuộc vào chủng nào được chọn. Đối với lựa chọn không rắc rối và kết quả tối ưu, có thể sử dụng puromycin điều chỉnh đặc biệt. Các dĩa chứa puromycin ổn định trong 1 tháng khi được lưu trữ ở nhiệt độ 4  [7] °C.